Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CENPPQ6IPU0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CENPPQ6IPU0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms