Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RALGAPA1Q6GYQ0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RALGAPA1Q6GYQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms