Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HIST2H2AA3Q6FI13 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HIST2H2AA3Q6FI13 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HIST2H2AA3Q6FI13 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms