Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LHX8Q68G74 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LHX8Q68G74 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHX8Q68G74 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms