Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATG16L1Q676U5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATG16L1Q676U5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms