Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC39.44■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
CHIC1Q5VXU3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC39.35■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.34■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
CHIC1Q5VXU3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC39.29■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CHIC1Q5VXU3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CHIC1Q5VXU3 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms