Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PRAMEF18Q5VWM3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRAMEF18Q5VWM3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF18Q5VWM3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms