Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACHD1Q5VU97 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACHD1Q5VU97 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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