Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EEF1A1P5Q5VTE0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EEF1A1P5Q5VTE0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms