Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RPRD2Q5VT52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RPRD2Q5VT52 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPRD2Q5VT52 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms