Protein–RNA interactions for Protein: Q5ST30

VARS2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS2Q5ST30 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VARS2Q5ST30 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VARS2Q5ST30 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VARS2Q5ST30 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VARS2Q5ST30 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VARS2Q5ST30 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VARS2Q5ST30 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VARS2Q5ST30 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VARS2Q5ST30 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VARS2Q5ST30 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARS2Q5ST30 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARS2Q5ST30 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VARS2Q5ST30 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms