Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HABP4Q5JVS0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HABP4Q5JVS0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms