Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FRMPD3Q5JV73 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD3Q5JV73 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FRMPD3Q5JV73 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms