Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRB2Q5IJ48 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CRB2Q5IJ48 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CRB2Q5IJ48 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms