Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL22Q53GT1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms