Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GREB1Q4ZG55 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GREB1Q4ZG55 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms