Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TPRNQ4KMQ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TPRNQ4KMQ1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
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