Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO43Q4G163 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO43Q4G163 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms