Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLFNL1Q499Z3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLFNL1Q499Z3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLFNL1Q499Z3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms