Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC25A52Q3SY17 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC25A52Q3SY17 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC25A52Q3SY17 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.9 ms