Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TSGA10IPQ3SY00 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSGA10IPQ3SY00 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSGA10IPQ3SY00 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms