Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP13-4Q3LI77 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KRTAP13-4Q3LI77 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms