Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD55Q3KP44 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD55Q3KP44 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD55Q3KP44 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms