Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PCGF3Q3KNV8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PCGF3Q3KNV8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms