Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL40Q2TBA0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL40Q2TBA0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL40Q2TBA0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms