Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL98

VMAC, Vimentin-type intermediate filament-associated coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMACQ2NL98 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VMACQ2NL98 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VMACQ2NL98 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms