Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR1Q2NL82 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSR1Q2NL82 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms