Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SWI5Q1ZZU3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SWI5Q1ZZU3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SWI5Q1ZZU3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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