Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDO1Q16878 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDO1Q16878 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDO1Q16878 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDO1Q16878 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
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