Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPN21Q16825 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPN21Q16825 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPN21Q16825 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
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