Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NFIL3Q16649 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NFIL3Q16649 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NFIL3Q16649 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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