Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TAF9Q16594 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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TAF9Q16594 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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TAF9Q16594 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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TAF9Q16594 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TAF9Q16594 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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TAF9Q16594 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF9Q16594 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF9Q16594 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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TAF9Q16594 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF9Q16594 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TAF9Q16594 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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