Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SGCAQ16586 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SGCAQ16586 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SGCAQ16586 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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