Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNMB1Q16558 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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