Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
DDB1Q16531 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
DDB1Q16531 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
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