Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PKN1Q16512 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKN1Q16512 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKN1Q16512 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PKN1Q16512 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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