Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNA1EQ15878 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CACNA1EQ15878 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CACNA1EQ15878 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms