Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
ALX1Q15699 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALX1Q15699 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
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