Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TWIST1Q15672 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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TWIST1Q15672 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TWIST1Q15672 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TWIST1Q15672 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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TWIST1Q15672 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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TWIST1Q15672 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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TWIST1Q15672 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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TWIST1Q15672 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TWIST1Q15672 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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