Protein–RNA interactions for Protein: Q15583

TGIF1, Homeobox protein TGIF1, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF1Q15583 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TGIF1Q15583 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TGIF1Q15583 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF1Q15583 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF1Q15583 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF1Q15583 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF1Q15583 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF1Q15583 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF1Q15583 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TGIF1Q15583 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
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