Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF1AQ15573 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TAF1AQ15573 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TAF1AQ15573 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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