Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLD3Q15054 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLD3Q15054 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms