Protein–RNA interactions for Protein: Q15018

ABRAXAS2, BRISC complex subunit Abraxas 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS2Q15018 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABRAXAS2Q15018 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABRAXAS2Q15018 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABRAXAS2Q15018 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms