Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
GAPVD1Q14C86 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC38.55■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC38.54■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
GAPVD1Q14C86 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
GAPVD1Q14C86 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms