Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NR1I3Q14994 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NR1I3Q14994 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NR1I3Q14994 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
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