Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF235Q14590 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF235Q14590 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF235Q14590 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms