Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEMA3AQ14563 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEMA3AQ14563 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEMA3AQ14563 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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