Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IKBKEQ14164 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IKBKEQ14164 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
IKBKEQ14164 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKEQ14164 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKEQ14164 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKEQ14164 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKEQ14164 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKEQ14164 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKEQ14164 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKEQ14164 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKEQ14164 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKEQ14164 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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