Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCARB2Q14108 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARB2Q14108 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARB2Q14108 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms