Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL9A2Q14055 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL9A2Q14055 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms